Hvordan beregne Sequence Dekning

berikelse studier krever beregning av sekvense data for å bestemme nivået på dekning. Dette gjøres primært med gensekvensering laboratorier som krever integrert DNA prøveopparbeidelse og pre - berikelse pooling. Beregning sekvense dekning krever bruk av variabler som inkluderer den midlere sekvense dekning, vil den totale målrettet baser og anrikning effektivitet. Utføre denne beregningen er gjort ved å legge inn alle disse variablene inn i en ligning . Instruksjoner
1

Skriv ut ligningen brukes til å beregne middelverdien sekvense dekning. Dette vil se ut som den ønskede dekning delt på gjennomsnittlig normalisert dekning. Hvis den ønskede dekning er 10x og gjennomsnittlig normalisert dekning er 0,2 , så den gjennomsnittlige sekvense dekning er 50.
2

Skriv ut ligningen brukes til å beregne mengden av sekvensering. Dette vil se ut (totalt målrettede baser ) (gjennomsnittlig sekvense dekning) /( berikelse effektivitet ) = mengde sekvensering.
3

Plugg inn 62 MB for " total målrettede baser " og 0,65 for den " berikelse effektivitet. " Tilsett sekvense dekning mengde 50x og ligningen vil se ut (62) (50) /0.65 . Resultatet av ligningen vil være 4,8 GB av sekvensdata .