* Ulike patronformater: DS og 3DS bruker forskjellige kassettformater. 3DS-kassetten er fysisk mindre og har forskjellige pinner for tilkobling til systemet.
* Programvarekompatibilitet: Selv om du fysisk kunne passe en DS-spillkassett i en 3DS, ville ikke 3DS-systemprogramvaren gjenkjenne den. 3DS er designet for å kjøre 3DS-spill, ikke DS-spill.
Slik spiller du DS-spill på en 3DS:
* Virtuell konsoll: 3DS har en «Virtual Console»-funksjon som lar deg laste ned og spille klassiske DS-spill digitalt. Disse spillene kjøpes gjennom Nintendo eShop og kan spilles på din 3DS.
* DSi-modus: Noen 3DS-modeller har en "DSi Mode" som lar deg spille DS-spill direkte. Denne modusen er først og fremst for kompatibilitet med eldre DS-spill og inkluderer ikke 3DS sine forbedrede funksjoner.
Merk: Du kan ikke sette inn en fysisk DS-kassett i en 3DS. 3DS er ikke bakoverkompatibel med DS-kassetter i så måte.